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Was er damit meint, ist daß in deiner .cc-Datei möglicherweise Windows-Zeilenenden verwendet werden (CR/LF ... bzw. Carriage Return / Line Feed), während unter UNIX/Linux normalerweise UNIX-Zeilenenden gebräulich sind (LF ... bzw. Line Feed). Lade die Datei z.B. mal in Notepad++ und dann wähle mal View -> Show Symbol -> Show End of Line.