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Welche portable Version ist es denn und von wo wurde es heruntergeladen?
Ich habe hier die Version von den "Portable Apps" drauf und da funktioniert alles (selbst das Öffnen von Bildern aus einem Ordner mit einem "Deppenapostroph" :-)).
Das bei den Dateiendungen nur "xcf" erscheint, deutet aber darauf hin, dass die Module zum Laden der anderen Dateien fehlen.
Im Ordner \gimp\lib\gimp\2.0\plug-ins sollten mehrere .exe-Dateien mit dem Namen file-xxx.exe (z.B. file-jpeg.exe) sein.
Werden Dir denn unter Help -> Procedure Browser diese .exe-Dateien auch angezeigt. Also insbesondere "file-jpeg-load" und "file-jpeg-save" sollten dort neben vielen anderen auftauchen.
Sonst könnte es auch noch sein, dass Dein Antivirus-Programm oder Deine Firewall das Ausführen der anderen Dateien blockiert oder sandboxed.