Kenne die technischen Details nicht...
Meine Erfahrung: NTFS ist zuverlässig, nahezu immun gegen Datenverlust (wenn die Hardware gesund ist), pfeilschnell und anwenderfreundlich. So kann man z. B. bei der Formatierung die Clustergröße zwischen 512Byte und *weiß nicht genau* frei wählen. Das Löschen dauert länger, weil NT die Daten auch wirklich löscht, anstatt die Bereiche einfach freizugeben. Die Sicherheitseinstellungen, die NTFS anbietet, sind für den einfachen Gamer nicht so wichtig, aber sicher sehr wünschenswert, wenn man am Inet hängt (Stichwort: Spionage).
Der große Nachteil von NTFS: W9x kann damit nix anfangen (für 98 ME weiß ich's nicht sicher). Daten auf NTFS-Partitionen kannst du also mit diesen Systemen nicht einmal auslesen. Außerdem habe ich den vagen Verdacht, daß einige der älteren Spiele (2 Jahre und mehr, also Prä-W2K) Probleme bekommen, wenn sie von NTFS-Platten laufen. Ist aber nur ein Verdacht, könnte auch an NT/2000 selbst liegen.
Für den W9x-Zugriff auf NTFS soll es Tools geben, aber darüber weiß ich nichts Genaues. Wenn einer mehr weiß: Würde mich stark interessieren!