- Registriert
- Aug. 2004
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Hallo zusammen,
wir haben hier eine Workstation aus:
Asus M5A97-Evo
AMD FX 8120
32GB Corsair Vengeance 1600MHz
und 1TB Datengrab
Betriebssystem ist Linux Mint 12
Man sieht schon an der Config das die Aufgabe etwas speziell ist. Wir assemblieren damit RNA Sequenzen mit 100bp länge in vollständige Gen Sequenzen. Dabei reden wir grob über 130.000.000 x 100bp.
Das ganze ist enorm Speicher intensiv und sobald der Arbeitsspeicher Vollläuft bleibt das System quasi stehen. Leider läuft der auch trotz 32gb noch voll. Daher muss jetzt eine effiziente Swap Lösung her. Jetzt gäbe es einmal eine normale SSD wie die Samsung 830 oder eine PCIe Karte wie das Z-Drive oder was ähnliches.
Habt ihr ne idee wie gross die Unterschiede grob sind? Liegen da Größenordungen dazwischen oder kann man auch zur normalen SSD greifen.
Danke für jeden Tip
Ned
wir haben hier eine Workstation aus:
Asus M5A97-Evo
AMD FX 8120
32GB Corsair Vengeance 1600MHz
und 1TB Datengrab
Betriebssystem ist Linux Mint 12
Man sieht schon an der Config das die Aufgabe etwas speziell ist. Wir assemblieren damit RNA Sequenzen mit 100bp länge in vollständige Gen Sequenzen. Dabei reden wir grob über 130.000.000 x 100bp.
Das ganze ist enorm Speicher intensiv und sobald der Arbeitsspeicher Vollläuft bleibt das System quasi stehen. Leider läuft der auch trotz 32gb noch voll. Daher muss jetzt eine effiziente Swap Lösung her. Jetzt gäbe es einmal eine normale SSD wie die Samsung 830 oder eine PCIe Karte wie das Z-Drive oder was ähnliches.
Habt ihr ne idee wie gross die Unterschiede grob sind? Liegen da Größenordungen dazwischen oder kann man auch zur normalen SSD greifen.
Danke für jeden Tip
Ned