Fortran korrekt installieren

Müs Lee · 30. November 2015

Ahoi,

ich bin überhaupt nicht mit Linux vertraut also bitte nicht gleich hauen

. Ich habe eine VM mit Ubuntu 15.10 unter W7 laufen (beides 64bit) und möchte den FEM-Solver Calculix darin laufen lassen, allerdings stellt sich Fortran noch quer. Ich habe es immerhin geschafft, das Fortranpaket 4.8 zu installieren, allerdings möchte CCX libgfortran.so.2 haben. Die Fehlermeldung lautet

Code:

./ccx: error while loading shared libraries: libgfortran.so.2: cannot open shared object file: No such file or directory

Die Lösung ist anscheinend eine symbolische Verknüpfung:

Code:

sudo ln -s /usr/libgfortran.so.4 /usr/libgfortran.so.2

Das hat auch geklappt, es erschien die Passwortabfrage und beim erneuten ausführen besteht die Datei bereits, allerdings erscheint die Fehlermeldung immer noch. Hat jemand eine Idee, wie man das ans Laufen kriegt?

Hancock · 30. November 2015

Ich glaub eher, dass /usr/ nicht in deinem Pfad zum Laden von Bibliotheken ist.
Mach mal ein ldconfig -p|less und schau, ob dein Pfad vorkommt.

Ich denke, besser kopierst du das (oder symlinkst) nach /usr/local/lib oder /usr/lib.

Bei mir ergibt ldconfig|grep fortran
libgfortran.so.3 (libc6,x86-64) => /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libgfortran.so.3

Müs Lee · 30. November 2015

Oha, das sollte natürlich

Code:

sudo ln -s /usr/libgfortran.so.4 /usr/lib/libgfortran.so.2

sein, hilft leider auch nicht. sudo ldconfig|grep fortran macht bei mir gar nix, die Liste mit ldconfig -p|less enthielt keinen Eintrag mit Fortran (außer er wäre mir entgangen).

Iapetos · 1. Dezember 2015

Wie hast du denn das Fortran-Paket installiert? Es erstaunt mich, dass das Ubuntu beigelegte Paket nicht gegen das mitgelieferte Shared Object verlinkt ist...

Müs Lee · 1. Dezember 2015

Über sudo apt-get install gfortran-4.8

Photon · 1. Dezember 2015

/usr/lib/gcc/x86_64-linux-gnu/4.8/libgfortran.so libgfortran-4.8-dev

Siehe http://packages.ubuntu.com/search?s...ame&searchon=contents&keywords=libgfortran.so Also versuche vielleicht libgfortran-4.8-dev zu installieren.

Müs Lee · 1. Dezember 2015

Hm, da kommt die Meldung

0 aktualisiert, 0 neu installiert, 0 zu entfernen und 46 nicht aktualisiert.

Damit hätte sich ja nix zur 4.8 geändert. Jedenfalls funktioniert Calculix damit auch mit erneutem Symlink nicht.

Photon · 1. Dezember 2015

Wie hast du denn den Symlink angelegt?

Müs Lee · 1. Dezember 2015

Na wie oben geschrieben:

Code:

sudo ln -s /usr/libgfortran.so.4 /usr/lib/libgfortran.so.2

Photon · 1. Dezember 2015

Aber die Datei liegt ja afaik in /usr/lib/gcc/x86_64-linux-gnu/4.8/libgfortran.so, nicht in /usr/lib/libgfortran.so.2.

Hancock · 1. Dezember 2015

Hmm, muss Linux DLLs erst registrieren?
Probier mal ein

Code:

sudo ldconfig -v|grep fortran

Dann sollte ldconfig alle .so suchen und die in die Liste aufnehmen. Wenn dann deine Libs nicht gefunden werden, dann wird's echt komisch. (BTW: Schau mal, wo denn all die anderen, bekannten Libs liegen und versymlinke mal da hin und teste, ob deine /usr/lib/libgfortran.so.2 valide ist ("file /usr/lib/libgfortran.so.2")).

Müs Lee · 2. Dezember 2015

Code:

/sbin/ldconfig.real: Pfad »/lib/x86_64-linux-gnu« mehrfach angegeben
/sbin/ldconfig.real: Pfad »/usr/lib/x86_64-linux-gnu« mehrfach angegeben
/sbin/ldconfig.real: /lib/x86_64-linux-gnu/ld-2.21.so is the dynamic linker, ignoring

	libgfortran.so.3 -> libgfortran.so.3.0.0

Allerdings weiss ich nicht, was ich damit anfangen soll. Wenn ich im Ordner /lib/x86_64-linux-gnu nach dem Stichwort Fortran suche, kommt nix zutage.

Photon · 2. Dezember 2015

Was sagt denn "sudo updatedb && locate libgfortran.so"?

Müs Lee · 2. Dezember 2015

Code:

/usr/libgfortran.so.1
/usr/libgfortran.so.2
/usr/libgfortran.so.4
/usr/lib/gcc/x86_64-linux-gnu/4.8/libgfortran.so
/usr/lib/x86_64-linux-gnu/libgfortran.so.3
/usr/lib/x86_64-linux-gnu/libgfortran.so.3.0.0

Photon · 2. Dezember 2015

Dann linke doch mit

Code:

sudo ln -s /usr/lib/gcc/x86_64-linux-gnu/4.8/libgfortran.so /usr/lib/libgfortran.so.2

oder vielleicht

Code:

sudo ln -s /usr/lib/gcc/x86_64-linux-gnu/4.8/libgfortran.so /usr/lib/gcc/x86_64-linux-gnu/4.8/libgfortran.so.2

Müs Lee · 2. Dezember 2015

Hm, jetzt kommt beim Ausführen von Calculix

Code:

./ccx: symbol lookup error: ./ccx: undefined symbol: _gfortran_internal_malloc

Irgendwie ist das wesentlich umständlicher als gedacht

Photon · 2. Dezember 2015

Da fehlt wohl die 32bit-Version: http://stackoverflow.com/questions/...y-occours-an-error-when-i-want-to-execute-ccx

Müs Lee · 2. Dezember 2015

Hm, doofe Frage: Welche Version ist denn jetzt die richtige? Ich weiß nicht, welche da eine 32bit-Version ist. http://packages.ubuntu.com/search?suite=all&arch=any&searchon=names&keywords=libgfortran Und wie gesagt, es tut mir leid dass man mir alles vorkauen muss, aber Linux ist wirklich komplett neu für mich.

Photon · 2. Dezember 2015

Macht doch nichts, jeder hat mal angefangen.

Ich denke, du brauchst /usr/lib/gcc/x86_64-linux-gnu/4.8/32/libgfortran.so in lib32gfortran-4.8-dev.

Müs Lee · 2. Dezember 2015

Hm, immer noch ./ccx: symbol lookup error: ./ccx: undefined symbol: _gfortran_internal_malloc. Im übrigen scheine ich keinen Ordner gcc zu haben

Ich habe das Paket wieder mit sudo apt-get install lib32gfortran-4.8-dev installiert.

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