Das größte Problem ist, dass du nie weißt, ob deine Eigenentwicklung Schwachstellen besitzt, die das ganze schon längst unbrauchbar gemacht haben und wähnst dich in falscher Sicherheit. Wenn in einem bekannten Verfahren eine Schwachstelle gefunden wird, dann besteht aber zumindest eine gewisse Chance, dass das an die Öffentlichkeit kommt, bevor die NSA sich das zu Nutze macht. Nicht umsonst gibt es jährlich mit Preisgeld dotierte Wettbewerbe.
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Ich weiß, was man an Kryptografie zu hören bekommt, und es reicht sicherlich nicht aus, um selbst ein gutes, weil neues Verfahren (keinen Abkklatsch) zu entwickeln. Ob es sich für die NSA lohnt oder nicht, deine Eigenkreation unter die Lupe zu nehmen, können wir hier wohl nicht beantworten... man könnte jedoch argumentieren, dass man gerade bei exotischer Verschlüsselung eher ein Ziel wird und die Leute dort einen Anreiz bekommen, sich das ganze mal näher anzuschauen. Über deren materielle und personelle Ressourcen kann man eh nur mutmaßen.