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Ich verwende VideoRedo, kostet zwar (IIRC ~ € 25,--), ist aber absolut empfehlenswert.
Es gibt auch Alternativen, so z.B. Cuttermaran (da ist es IMO aber erforderlich dass Du das .mpeg vorher demuxt, was man VideoRedo nicht machen muss, das kann - u.a. - .mpegs verarbeiten).