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Ein neues Mainboard ist nötig um von DDR2 auf DDR3 umzurüsten. Zudem ist DDR3 mit solch geringem Takt langsamer als dein DDR2 800, der hat wesentlich kürzere Zugriffszeiten. Und selbst wenn du auf DDR3 2000 umsteigen würdest, würde man lediglich in Messungen einen Unterschied nachweisen können, spüren würdest du den Unterschied im normalen Gebrauch aber nicht.
Der Wechsel von DDR2 800 auf DDR3 1066 lohnt sich nicht, da wie von Dr. MaRV schon gut erklärt, du keinen spürbaren Vorteil erziehlen wirst. Zudem bräuchtest du ein neues MB. Spar dir lieber das Geld und rüste irgendwann mal richtig auf bzw. bau dir nen neuen PC zusammen, falls dir der alte nicht mehr als ausreichend erscheint.
Die Zugriffszeiten sind beim DDR2-800 schneller als bei DDR3-1066, der Vorteil bei DDR liegt im geringeren Energieverbrauch und der höheren Datenübertragungsrate. Also es kommt auf den Blickwinkel an, teilweise ist dein DD2-800 Leistungsfähiger als DDR3-1066.