Du beschwerst dich über die Performance des Raidcontrollers und die Lösung soll ein Software Raid sein? Nunja

Meine erste Vermutung ist das Windows den Festplatten evtl. einen Index verpasst und du im BIOS einfach die Bootreihenfolge umdrehen musst, weil du im Moment von der zweiten Platten booten willst. Ist aber nur ne Vermutung, ich kenne das Menü von Windows 2008 dazu nicht und weiß auch nicht wie es das intern handhabt.