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Für die am Motheboard brauchst du ja Adapter, d.H. weitere Kosten! Fürs Netzteil entstehen da keine weitere Kosten. Beide LüSteus sind ja temperaturabhängig und dürften über PWM funktionieren, was ja bekanntlich nicht so prickelnd ist.
Das Bequiet ist glaube ich analog. Aber die Regelkurve ist nicht so toll. Man findet sie auf der Internetseite von Be Quiet im Datenblatt. Anscheinend ist sie Lastabhängig, aber sehr unempfindlich. Bis 50% Last passiet nichts und dann steigt die Lüfterspannung bis 90% an.
D.h, dein Computer kann sekundärseitig 250W (ein FX-60 und zwei 7900gtx ziehen etwa 270W) ziehen, ohne das die Lüfter hochgeregelt werden. Daher würde ich eher die Mainboardsteuerung nehmen.