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Würde mal sagen IMAP, weil da nur die Headers geladen werden, und die eigentlichen Mails weiter auf dem Server bleiben. (Bei POP gibts auch Optionen das die Mails auf dem Server bleiben - aber die müssen dann manuel gelöscht werden)
Bei POP wird das ganze Mail heruntergeladen, was aufgrund der Grösse und Geschwindigkeit/Netzleistung unter Umständen viel Zeit benötigt.. Daher würde ich persönlich IMAP bevorzugen, wo immer möglich..