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Ist sonst die aktuellste Firmware drauf? Ich hab grad in der Anfangszeit von meinem QNAP recht oft erlebt, dass so einige Firmware-Releases in irgendeiner Weise Bugs hatten. Also ggf. mal noch mit einem neueren Release probieren.
Ich komm mit meinem 2011er Single Bay QNAP in der selben Windowsanzeige sonst auf sehr konstante 43MB beim schreiben aufs NAS und sehr konstante 80MB/s beim Lesen wenns eine einzelne grosse Datei kopiert wird.
irgendwo in den QNAP Apps konnte man auch ipkg (ich glaub es war ipkg) Packages installieren, da verbergen sich dann unzählige Linuxübliche Kommandozeilentools, da müsste auch bei QNAP „iperf“ oder „iperf3“ verfügbar sein. Das gibts als Gegenstück auch für Windows und Linux als Open Source Tools, das umfasst einen Listener und einen Client für Netzwerk-Durchsatztests. Du kannst also beide Netzwerkrichtungen ohne Diskzugriffe mal durchmessen.
Das ist aber ein Kommandozeilentool, da musst du dich per SSH/Putty zum QNAP verbinden. Auch die iperf-Package-Installation läuft über Kommandozeile. Kann sein, dass du dich da erstmal etwas einlesen musst.