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Du hast einfach z.b. bind9 bei dir aufm Rootserver laufen, beim Domain-Registrar kannst du im Normalfall einen eigenen DNS eintragen (das wird dann im Root-DNS hinterlegt).
Per Skript änderst du das Zone-File in deinem DNS, und da im Root-DNS steht das die tatsächliche Auflösung dein DNS macht kommt jede Anfrage bei dir an. Es gibt natürlich DNS die Cachen (z.b. Telekom), damit die das nicht tun musst du das TTL sehr niedrig setzen. Eine Schritt für Schritt Anleitung sollte eine Suchmaschine deiner Wahl liefern können (In meinem Test eben war es Ergebnis #4).