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Bei einer SSD spielt so ein Format C:\, was ja vor allem die Fragmentierung des Filesystems mal wieder aufhebt, kaum eine Rolle. Wenn die Fragmentierung extrem wird, kann es natürlich auch auf die Leistung gehen, weil statt weniger lange und damit schneller Zugriffe viel kurze und somit auch langsame Zugriffe erfolgen müssen. Das betrifft aber immer nur die fragmentierten Dateien, also die später geschriebenen.
Von CCleaner würde ich abraten, der hat schon einigen das System versaut. Wenn Du ein aktuelles Backup hast, kannst Du es ja mal versuchen. Ansonsten würde ich einfach mal schauen, was da so alles im Autostart liegt (z.B. mit dem Tool Autoruns von sysinternals) und überlegen, was davon wirklich gebraucht wird.
vielleicht hilft es ja, wenn du verschiedene Programme im Autostart zeitverzögert startest?
Also die wichtigen zuerst und dann, wenn das System an sich stabil läuft, die restlichen (Updater, etc.). https://www.computerbase.de/forum/threads/autostart-verzoegern.1173422/
Eventuell geht das aber nicht mit Treibern, da diese ja unbedingt benötigt werden...
Ich könnte mir auch vorstellen, dass du verschiedene Dienste von Windows in der Diensteverwaltung auf
zeitverzögert stellen solltest. Dann wird das OS nur mit dem "Notwendigsten" gestartet...