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Nimm die Western Digital Caviar Blue 640GB und installiere da dein Betriebssystem und deine Programme, Spiele usw. die ist die schnellere von den beiden, die Seagate Platte würde ich zum speichern der Eigenen Dateien verwenden.
Bei Seagate ist es glaube ich wie bei WD. Die 1 Platter Festplatten haben eine höhere Zugriffszeit. Während die 500GB Platte ST3500320AS eine sehr gute Zugriffszeit von 12,5ms hat, hat die 250GB Platte wohl nur so 15ms.
Die WD6400AAKS hat eben auch so 12,xms,.