Die Deluxe-Edition (in Italien, Deutschland, Österreich und der Schweiz Professional Edition genannt) enthält zusätzlich ein Software Development Kit (leider fehlen im Anleitungsheft sowie im Programm selbst jegliche Hinweise auf dieses SDK), drei Flugzeuge mit dem Garmin G1000 Flight Deck sowie die Möglichkeit, die Rolle eines Fluglotsen einzunehmen. Erstmals kann man (in beiden Versionen) ohne Addons Tankwagen, Finger und Gateways an das Flugzeug rollen lassen. Im Funkverkehr wird das Modul des FS2004 und FS2002 mit leichten Änderungen verwendet[1].
Mit der Deluxe-Edition kann man zum ersten Mal in der Geschichte des Flight Simulators als Fluglotse den Luftverkehr im Multiplayer steuern. Außerdem ist es möglich online zusammen mit einem anderem ein einziges Cockpit zu nutzen (ein Spieler ist Pilot, der andere Copilot).
