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Von MatheGrafix gibt es eine Demo-Version, mit der man Diagramme erstellen kann...ist aber recht umständlich und schlecht, aber was anderes als das OpenOffice-Programm kann ich dir sonst nicht empfehlen
Ein nettes Programm was auch an Unis verwendet wird ist ebenfalls GPL und nennt sich ganz einfach "R" , aktuell ist Version 2.0.0 afaik.
URL: http://www.r-project.org/