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Japp. Du kannst da quasi so wild mischen wie du willst. Ob unterschiedliche Drehzahlen, Größe oder (je nach Controller) auch Anschluss (also IDE/SATA). Es limitiert dann halt immer das schlechtere, weswegen man in der Regel zwei identische Festplatten nutzt.
Ich gehe mal davon aus, dass du kein RAID-0 einsetzen willst (weil da der einzige Vorteil die Performance sein kann). Generell sollte es aber wie von AndrewPoison geschrieben keine Probleme geben, es limitiert halt wie gesagt die jeweils langsamste Platte das gesamte System, die Frage ist ob das RAID in dem Fall überhaupt Sinn macht. Wofür genau willst du das RAID denn verwenden?
