Dummes Creative, würde ich sagen.
Mal davon ausgehend, dass du Gnome verwendest: worauf steht denn die Standard-Ausgabe, wenn du auf den Speaker klickst? Hast du den korrekten Port gewählt? Mit Auto-Erkennung hats Linux nicht so, du musst manuell wählen, ob du den analogen oder digitalen Port haben willst. Bei mir ist die Liste z.B. monströs lang: NVidia Digital (von der Grafikkarte), Realtek Digital, Realtek Analog, Creative Digital, Creative Analog.
Ich hatte gestern auffem frischen Ubuntu auch erstmal das Problem, dass er in der Rhythmbox korrekt meine Creative Analog angesprochen hat (uralte Creative-Boxen), im Chrome hingegen irgend was anderes wollte. Ich hab dann bei offenem Browser n paar mal im Audio-Mixer auf den Creative Analog-Ausgang geklickt, irgendwann hat ers gerafft. Ein tieferer Sinn hat sich mir nicht erschlossen.