Ich weiß zwar nicht, warum man das tun sollte, da es für die verlustbehafteten Formate einen weiteren Qualitätsverlust bedeutet, da du neu encodieren musst.
Aber zumindest bei MP3 kannst du auf Datei -> Exportieren gehen, dort MP3 auswählen und dann bei den Encodierungsoptionen "Joint Stereo" auswählen.