Also das mit dem Fenster hab ich so gelöst, dass ich die exe einfach zum Autostart hinzugefügt hab - aber aufs einwählen muss ich auch noch selber klicken :/
Run("programpfad") ;starte program
If WinWait("fenstertitel",4) Then ;warte 4 sek bis fenster da
ControlClick("fenstertitel","ButtonText") ;click auf button
EndIf