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Lüfter vom MB steuern lassen...
Deckel würde ich montieren, sollte für weniger Staub im Gehäuse sorgen.
Von den Temperaturen ist es evtl. Messbar, also einen großen nachteil/Vorteil solltest nicht haben.
(macht der Deckel vorne die Lüfter zu? Wenn ja, den weglassen)
Edit. Die Lüfter vorne bekommen dennoch genug Luft durch die schlitze seitlich.