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Nein, im Endeffekt werden nur App-Icon und mit der App assoziierte Daten gelöscht. Beim Download über den App-Store werden nur das Logo und entsprechende Verbindungen wiederhergestellt.
Apps wie Mail, Kalender etc. sind tief im System integriert und werden folglich auch bei jedem iOS-Update, egal ob "deinstalliert"/versteckt oder nicht geupdatet.