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ich hab solche Controller http://geizhals.at/deutschland/317498
schon mehrfach verbaut, allerdings auf Intel-Boards.
Daran angeschlossene HDDs sind bootbar, weil sich die Karte PCI-konform verhält.
Leider ist die Frage, wie "normal" sich das AMD-BIOS von Gigabyte dazu verhält; was das BIOS jedes noch so popelige Boards kann, ist für GB noch lange kein Maßstab.
Den Spezifikationen nach hat das BIOS durch Abklappern des PCI-Bus zu erkunden, was da überall dranhängt. Jeder Controller (auch die am PCI-E eingesteckten) meldet dann brav, wieviel MMIO-Speicher er braucht und ob er ein BIOS-Segment zur Steuerung übertragen will.
Nach dem POST gibt es dann den Hinweis: "press Fxx to enter Controller xy BootROM interface", worin man dann zB RAID-Controllerkonfigurationen vornehmen kann.
Im Falle Deines Controllers meldet der einfach die bei ihm angeschlossenen Devices (HDDs oder in RAID-Konfiguration die Arrays) , welche das BIOS dann in die Auswahl der Boot-Devices übernimmt, die Du dann selektieren kannst...