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Soweit ich weiß kann man ePub-Dateien in iTunes importieren und diese dann auf den iPod synchronisieren und mit iBooks öffnen/lesen.
Habs allerdings selbst noch nicht ausprobiert.
Wenn dein Buch ein DRM-Schutz hat, dann kann das möglicherweise ein Problem werden. Ansonsten laufen normale ePub Bücher ohne Probleme in iBook. Möglicherweise bietet der Hersteller des Buches auch eine eigene Lesesoftware an. Da müsstest du dann mal im AppStore gucken.