So wie ich den Ersteller verstanden habe, geht es nicht um den Wechsel auf Wasser sondern von einer AIO zu einer Custom WaKü.
In Ausnahmefällen kann es meiner Meinung nach schon passieren, dass man mit einem Custom Loop schlechtere Werte erzielt.
Ohne GPU im Loop:
Es ist weniger Luftzirkulation im Gehäuse wenn man einen größeren Radiator verbaut als vorher.
Die Radiatoren nehmen ein gutes Stück im Gehäuse ein und blockieren auch die Ein-, und Auslässe vom Gehäuse.
Wenn man nur Lüfter verbauen würde + AIO für die CPU, dann hätte man mehr frische Luft für GPU - also schlechtere Temperatur bei der GPU.
Durch mehr Lüfter und die Pumpe benötigt man mehr Kabel im Gehäuse, vielleicht ist das Mainboard dann nicht mehr ausreichend (heutzutage eher nicht mehr der Fall).
Mit der GPU im Loop:
Die GPU bekommt das warme Wasser von der CPU ab, das ist bei einer AIO nicht der Fall.
Wie stark sich soetwas auswirkt kann ich selbst leider nicht beurteilen aber mit einem Radiator im Custom Loop für CPU und GPU wäre die Performance in bestimmten Fällen (z.B. kleines Gehäuse/dünner Radiator) schlechter als die AIO.
Die Frage ist natürlich auch wie man die Performance sieht.
Preis/Leistung ist die Custom (in den meisten Fällen) einfach nicht vergleichbar mit einer AIO.
AIO kriegt man schon für 100€, die GPU hats chon Lüfter verbaut.
Bei einer Custom brauchst du mindestens AGB, Pumpe, Schlauch, Fittings, Radiator, Flüssigkeit und den Block für die zu kühlende Komponente.
Von den ganzen Fehlerquellen möchte ich gar nicht erst anfangen.