Ich kenn zwar den Lüfter vom Mugen 3 nicht, kann also nicht vergleichen, aber zum Ninja3-Lüfter kann ich was sagen:
Wenn der Dreheregler bis ca. 25% gesetzt ist, ist der Lüfter eigentlich kaum noch zu hören, er ist zwar kein Ultra-Silent-Lüfter, aber er ist auf einem guten Niveau. Bis ca. 50% ist's grenzwertig, danach hört man ihn dann doch recht deutlich...
Was allerdings gesagt werden muss: Über den 25% klingt der Lüfter beim Raufregeln (über die Mobo-PWM-Steuerung) absolut nervig! Also entweder Steuerung aus, oder unter 25% laufen lassen, anders halte ich persönlich das Teil nicht aus... Kühlleistungstechnisch liebe ich das Teil, selbst bei minimaler Stellung des Lüfters + Silent-Steuerung durch's Mainboard bleibt mein E8500 unter 42-44°C (Prime/Gaming).
Bemerkung am Rande: Bei meinem Mainboard musste ich die Drehzahl-Überwachung vom Lüfter deaktivieren, andernfalls startete das System nur, wenn der Regler über ca. 40% war...