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hab auch beide drauf und keine probleme mit. du lässt beide tool ja nich parallel auf fehler prüfen und selbst wenn... denk nich, dass es probleme damit gibt.
Habe beide Tools im Einsatz (TuneUp Utilities 2009 + CCleaner) sowohl unter Windows XP SP3 als auch unter Windows Vista Ultimate SP1 32 Bit+64 Bit Edition gibt es keine Probleme. (Verschiedene PCs).
CCleaner nutze ich Hauptsächlich um Temporäre Dateien sowie Internet Cookies und den Browsercache zu löschen. TuneUp Utilities um Fehler in der Registry usw. zu beheben.