In diesem Fall würde ich über den Austausch des Gehäuselüfters nachdenken, da Lüfter, welche nur über einen 4pin-Molex-Stecker verfügen (also solche, die an die Laufwerksstecker des Netzteils angeschlossen werden), weder über das Netzteil noch über das Mainboard regelbar sind. Wenn er Dir also unter 12 V zu laut ist, wäre ein Tausch gegen ein leiseres Modell am besten, und günstiger als eine geeignete Lüftersteueurng, welche ohnehin meistens nur 3polige Lüfter steuern kann.
Es ist allerdings komisch, dass Dein Lüfter nicht anläuft, weil am Laufwerksstecker des Netzteils stets 12 V anliegen, da sollte die Anlaufspannung keine Rolle spielen! Was ist es denn für ein Lüfter (Hersteller, Modell), evtl. ist er defekt? Und hast Du es 'mal mit einem anderen laufwerksstecker des Nt versucht (auch, ob evtl. falsch herum angeschlossen)?
LG N.