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Einfach einen zweiten Prime-Ordner anlegen mit dem gesamten Inhalt (schlicht und einfach kopieren).
Dann aus beiden Ordnern Prime starten und im Taskmanager Prime1 dem Ersten Kern und Prime2 dem Zweiten Kern zuordnen.
Das mit dem kopieren in einen neuen Ordner habe ich schon gemacht. Wenn ich dann daraus Prime95 starte während das andere läuft, macht es einfach die erste Anwendung zu und die neue auf, komisch....
Es gibt eine Kommandozeilenoption für prime95 mit der man die zweite Instanz (im gleichen Verzeichnis) starten kann: -A2 (bzw. An für die n-te Instanz)