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Das mit den MBRs ist kein Problem, stöpsel die Linux-Platte ruhig ab (Windows' Bootloader kann eh kein Linux booten). Dann stellst du im Bios ein, dass von der Linuxplatte gebootet werden soll, lässt unter Linux die Platte einbinden und schreibst in der /boot/grub/menu.list einen Eintrag für Windows rein.
Das lag tatsächlich an den ahci Einstellungen des BIOS. Habe leider nur die ersten 3 Posts dieses Threads gelesen.
Das Komische ist jetzt, dass XP definitiv auf (hd1,0) oxidiert. Aber das begreift Grub nicht. Der will da immernoch das alte Debian starten...