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Man kann nur ganze Partitionen klonen, es aber eben geht nicht nur Windows und Treiber von einer Partition zu klonen ohne auch den Rest mitzunehmen. Zumindest wäre mir kein Tool bekannt welches dies ermöglicht.
Dann musst Du halt so vergleichen welche Unterschiede es zwischen beiden Windows Versionen gibt, vor allem bzgl. der Treiberversionen und den Einstellungen. Da und nicht bei der SSD dürfte der Schlüssel für die Lösung des Problems liegen.